Основные труды – в области полярной океанологии, экологии моря, геоморфологии и палеогеографии океана. Разработал принципиально новую концепцию морских экзогенных процессов в ледниковый период, создал оригинальную модель четвертичного оледенения Баренцево-Карского региона. Внес существенный вклад в развитие биоокеанологии, в том числе в изучение биопродуктивности и современного состояния биоресурсов морей Западной Арктики, в создание прогностических моделей эволюции полярных экосистем. Им впервые созданы детальные батиметрические карты Северной Атлантики и Северного Ледовитого океана. Организатор, руководитель и участник многих высокоширотных экспедиций. В 2006-2007 гг. составлены современные карты Азовского моря (батиметрическая и донных отложений). Внес большой вклад в развитие комплексных исследований восстановления и сбережения осетровых рыб в Южном федеральном округе. Академик Г.Г. Матишов выступил инициатором и организатором крупномасштабных комплексных исследований социально-политической ситуации в южном регионе России. Под его научным руководством создано уникальное справочно-информационное издание в четырех томах – «Атлас социально-политических проблем, угроз и рисков Юга России» (2006-2009). Внес большой вклад в укрепление и расширение научного сотрудничества в области морских наук с научными организациями Европы, США, Канады, странами СНГ. Неоднократно поощрялся государственными и ведомственными наградами: медаль «Ветеран труда» (1985), Кавалер Ордена «Знак Почета» (1986), медаль «300 лет Российскому Флоту» (1996), Кавалер Ордена «Почета» (1999), почетная грамота Министерства образования и науки Российской Федерации (2004), Кавалер Ордена «За морские заслуги» (2004), лауреат премии Правительства Российской Федерации 2005 г. в области науки и техники, лауреат премии РАН им. О.Ю. Шмидта (2007). В 2010 году Указом Президента РФ награжден орденом «За заслуги перед Отечеством» IV степени. Является главным редактором журнала «Вестник Южного научного центра», сопредседателем редакционного совета журнала «Юг России: экология, развитие», членом редколлегии журнала «Биология моря» и журнала «Океанология» Польской академии наук. Продолжает работу в должности заведующего кафедрой «Технические средства аквакультуры» Донского государственного технического университета, а также заведующего базовой кафедрой «Физическая география морей и океанов» Кубанского государственного университета. Важнейшие труды за последние 2 года:  Матишов Г.Г., Берестовский Е.Г. Сохранение разнообразия лососёвых рыб северных и дальневосточных регионов России // Вестник РАН, 2010, том 80, № 1, с. 52-56.  Матишов Г.Г., Денисов В.В., Жичкин А.П. География промысла трески как индикатор экосистемы Баренцева моря // Известия РАН. Серия географическая, 2010, № 1, с. 112-119.  Матишов Г.Г., Пономарева Е.Н., Балыкин П.А. Аквакультура: мировой опыт и российские разработки // Рыбное хозяйство, 2010, № 3, с. 24-27.  Миус-фронт в Великой Отечественной войне. 1941/1942 гг. 1943 г. – Ростов-на-Дону: Изд-во ЮНЦ РАН, 2010. – 216 с.  Матишов Г.Г., Макаревич П.Р., Дженюк С.Л., Денисов В.В. Морские нефтегазовые разработки и рациональное природопользование на шельфе. – Ростов-на-Дону: Изд-во ЮНЦ РАН, 2009. – 500 с.  Матишов Г.Г., Кринко Е.Ф., Власкина Н.А., Бритвина Е.А. Социально-исторический портрет села Приазовья: Кагальник. – Ростов-на-Дону: Изд-во ЮНЦ РАН, 2009. – 208 с.  Матишов Г.Г., Батиев Л.В., Пащенко И.В. Атлас социально-политических проблем, угроз и рисков Юга России. Том IV. Специальный выпуск: причины и обстоятельства роста напряженности, поиск путей стабилизации на Северном Кавказе. Ростов-на-Дону: Изд-во ЮНЦ РАН, 2009. – 120 с.  Матишов Г.Г., Матишов Д.Г., Пономарева Е.Н., Сорокина М.Н., Казарникова А.В., Коваленко М.В. Осетроводство в условиях замкнутого водоснабжения для фермерских хозяйств. – Ростов-на-Дону: Изд-во ЮНЦ РАН, 2008. – 112 с.  Матишов Г.Г., Авксентьев В.А., Батиев Л.В. Атлас социально-политических проблем, угроз и рисков Юга России. Том III. Ростов-на-Дону: Изд-во ЮНЦ РАН, 2008. – 176 с.  Матишов Г.Г., Матишов Д.Г., Пономарева Е.Н., Сорокина М.Н., Казарникова А.В., Коваленко М.В. Основы осетроводства в условиях замкнутого водообеспечения для фермерских хозяйств. Ростов-на-Дону: Изд-во ЮНЦ РАН, 2008. – 112 с.  Матишов Г.Г., Бердников С.В., Савицкий Р.М. Экосистемный мониторинг и оценка воздействия разливов нефтепродуктов в Керченском проливе. Аварии судов в ноябре 2007 г. Ростов-на-Дону: Изд-во ЮНЦ РАН, 2008. – 80 с.  Емельянов В.В., Матишов Г.Г., Самойлова М.А., Селютин В.В. Социально-экономические процессы на Юге России в 2000-2006 гг. Ростов-на-Дону: Изд-во ЮНЦ РАН, 2008. – 463 с.  Матишов Г.Г., Матишов Д.Г., Гаргопа Ю.М., Дашкевич Л.В., Бердников С.В., Кулыгин В.В., Архипова О.Е., Чикин А.Л., Шабас И., Баранова О., Смоляр И. Климатический атлас Азовского моря 2008. NOAA Atlas NESDIS 65, U.S. Government Printing Office, Washington, D.C., 148 pp., CD-ROM. Ключевые слова Специалист в области полярной океанологии, экологии моря, геоморфологии и палеографии океана, радиоэкологии Арктики.